分公司不行，子公司可以。因为分公司没有资格单独申请高新技术企业认定的资格，但是可以与总公司共同享受税收优惠。子公司是具有独立法人资格的，因此只要符合《高新技术企业认定管理办法》中的相关要求，就可以单独申请高新技术企业的认定，且成功认定后同样能享受到税收优惠。